Luiz, não é necessário uma base de madeira, mas como dificilmente o boneco se sustentará sem uma estrutura que opere como um esqueleto dele, (e mesmo que consiga quando for ao forno vai desmilinguir todo) é importante um esqueleto de arame. Para facilitar a construção deste esqueleto, se usa uma base de madeira. A função da base é manter as coisas no lugar. Nada impede que após a peça assada você corte o arame sob a base e liberte o boneco dela. Mas a base é importante no processo de fazer o boneco, pois libera uma mão do artista para o trabalho.
E a massa trabalha junto com durepoxi sim, mas não mistrurando, porque o durepoxi endurece via reação quimica e a polyclay via reação termica. Mas eu uso corretemnete a combinação de epoxi + polyclay em meus projetos. Veja no caso do boneco do John Locke aqui no blog mesmo. Eu fiz o Locke de polyclay e a base toda de epoxi.